Neben den Individualisierungsmöglichkeiten wird auch die Sicherheit groß geschrieben. Der Kona wird dank Hyundai SmartSense in seinem Segment Maßstäbe setzen. Der kleinste SUV von Hyundai fährt bereits in der Ausstattungsvariante Pure mit aktivem Spurhalteassistent und Aufmerksamkeitsassistent vor. Ab der Ausstattungslinie Select serienmäßig ist ein autonomer Notbremsassistent inklusive Frontkollisionswarner mit Fußgängererkennung, der für das Einstiegsmodell Pure optional lieferbar ist. Außerdem werden Totwinkelwarner und Querverkehrswarner hinten angeboten. Bei allen Varianten kommen ab Werk unter anderem Bergabfahr- und Berganfahrassistent sowie Lichtsensor hinzu. Einen weiteren Beitrag zur Sicherheit leisten die Voll-LED-Scheinwerfer, die in Verbindung mit Abbiegelicht und Fernlichtassistent angeboten werden. Seit dem Frühsommer 2019 steht für das Top-Modell Premium zudem eine adaptive Geschwindigkeitsregelanlage inklusive Abstandsregelung optional zur Verfügung. Bei allen Modellen mit Doppelkupplungsgetriebe 7DCT sorgt das System dafür, dass die vorgewählte Geschwindigkeit in Abhängigkeit von der Distanz zum Vordermann automatisch angepasst wird.