Von meisterhaft verarbeitetem Leder oder feinsten Stoffen über sorgfältig ausgewählte Holzapplikationen bis hin zu verchromten Metallen – das Interieur des Phaeton kreiert eine einzigartige Atmosphäre zeitloser Eleganz und ausgewogener Ästhetik. Darüber hinaus bietet der Phaeton ein überdurchschnittlich großes Rauman­gebot. Das sogenannte Komfortmaß – eine definierte Raumgröße für die Reisenden vorn und hinten – die Schulterraumbreite vorn und die Kniefreiheit hinten sind jeweils „best-in-class“.

Die Vordersitze des Phaeton lassen sich über ein Zwölf-Wege-System für jede Körpergröße optimal einstellen und erlauben einen unübertroffenen Sitzkomfort. Im Phaeton W12 und ansonsten optional genießen Fahrer und Beifahrer den Komfort von 18-Wege-Sitzen. Die viersitzigen Versionen des Phaeton sind im Fond mit zwei 10-Wege-Sitzen ausgestattet.

Die Phaeton-Versionen mit verlängertem Radstand bieten den hinteren Passagieren eine um zwölf Zentimeter vergrößerte Beinfreiheit. Mit zusätzlichen Features wie Sonnenschutzrollos für die hinteren Seitenscheiben und die Heckscheibe sowie der Fondbedienung der Vierzonen-Klimaanlage erfüllen sie alle Ansprüchen an eine luxuriöse Chauffeur-Limousine.

Als weltweit erstes Automobil erhielten die Vorder- und Rücksitze des Phaeton im November 2002 von der unabhängigen Organisation „Aktion Gesunder Rücken e.V.“ das AGR-Gütesiegel. Die Experten­kommission würdigte damit die herausragenden ergonomischen Eigenschaften der Fauteuils. Aufgrund der strengen Prüfkriterien und der Besetzung der Jury mit medizinischen Experten genießt das AGR-Gütesiegel allgemein hohe Wertschätzung. Nach Ansicht des Fachgremiums entwickelte Volkswagen mit dem Phaeton ein Fahrzeug, „das allen Insassen ein rückengerechtes Reisen ermöglicht“.